All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Targeted protein degradation in plant hormone cytokinin responses

Public support

  • Provider

    Ministry of Education, Youth and Sports

  • Programme

  • Call for proposals

  • Main participants

    Mendelova univerzita v Brně / Agronomická fakulta

  • Contest type

    M2 - International cooperation

  • Contract ID

    MSMT-539/2017-1

Alternative language

  • Project name in Czech

    Cílená degradace proteinů v odpovědi na rostlinný hormon cytokinin

  • Annotation in Czech

    (1) Příprava nových mutantních linií. CRISPR/Cas9 systém pro cílenou mutagenesi bude využit pro přípravu mutant v genech komponent ubiquitinační dráhy. Cílem bude příprava mutant v genech UBC (AtUBC7, 15, 17, 22, 34, 37) a KMD (KMD3), pro které nejsou známé žádné T-DNA inserční mutanty. V závislosti na úspěšnosti budou přednostně připraveny nejvíce slibní kandidáti (AtUBC15, 17, 22, 37), nebo všechny výše uvedené mutanty. (2) Příprava vícenásobných mutant křížením či užitím CRISPR/Cas9 na jednonásobném mutantu. (3) Fyziologická analýza dostupných a nově připravených mutant. Analýza bude zahrnovat škálu standardních analýz, která umožní mimo studium role cytokininu i testovat ovlivnění dalších drah a mimo jiné bude doplněna o transformací funkčních kopií genu do mutantní linie pro doplňující srovnání. (4) Proteomická analýza účinků narušení proteasomové signalizace na úrovni proteomu. Bude užito rozsáhlého profilování proteomu pro analýzu (i) dostupných a nově připravených mutant a (ii) dostupných transgenních linií s narušenou cytokininovou homeostasí či proteasomovou dráhou. Studie bude zaměřena především na klíčení a brzký vývoj klíčních rostlin. V průběhu klíčení je proteinová degradace a hormonální signalizace velmi důležitá. Narušením ubiquitin-proteasomové kaskády a/nebo cytokininové signalizace se proteiny určené k degradaci budou hromadit a to umožní jejich identifikování. Druhá část, analýza interakce proteasomu a cytokininové signalizace na úrovni klíční rostliny, nám umožní navázat na předchozí výsledky a s využitím cílené proteomické analýzy budeme sledovat změny v abundanci identifikovaných proteinů cytokininové odpovědi.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    CE - Biochemistry

  • CEP - secondary branch

    EB - Genetics and molecular biology

  • CEP - another secondary branch

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Project results evaluation

    This project was being realized in the framework of the MOBILITY Activity that aims primarily on establishing and strenghtening ties with foreign research institutions. The control of particular outputs is not implemented by the evalution committee, but the correctness of allocated finances and the adequacy of their use are checked.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2017

  • Realization period - end

    Dec 31, 2018

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Feb 26, 2018

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP19-MSM-7A-U/01:1

  • Data delivery date

    Jun 18, 2019

Finance

  • Total approved costs

    175 thou. CZK

  • Public financial support

    175 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK