Multiscale analysis of signalling phospholipids and their interaction protein partners in the regulation of plant tip growth
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Main participants
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-19073S
Alternative language
Project name in Czech
Mnohaúrovňová analýza funkce signálních lipidů a jejich vazebných proteinů v regulaci vrcholového růstu rostlinné buňky
Annotation in Czech
Minoritní membránové fosfolipidy jako kyselina fosfatidová (PA), diacylglycerol (DAG) a fosfatidylinositol 4,5-difosfát (PIP2) regulují buněčnou polaritu a váčkový transport u kvasinek a živočišných buněk. V tomto projektu budeme zkoumat roli PA a DAG v koordinaci s PIP2 jako lokalizačních podnětů, které cílí efektorové proteiny na specifické membrány nebo membránové domény. Jako jednobuněčný modelový rostlinný systém s výhodou využijeme vrcholově rostoucí pylové láčky tabáku. Budeme hledat nové PA, DAG a PIP2 efektorové proteiny a kombinací experimentálních a výpočetních přístupů budeme charakterizovat jejich vzájemnou funkční interakci v buněčné polaritě. Souběžně se zaměříme na strukturně-funkční studie vazby lipidů s podjednotkami proteinového komplexu exocyst, jehož funkci ve váčkovém transportu rostlin jsme popsali. Vzhledem k jedinečnému poměru hladin lipidů v rostlinných membránách budeme studovat možnou kooperativitu PA, DAG a PIP2 a jejich mikrodoménovou organizaci v lipidové dvojvrstvě s využitím pokročilých mikroskopických technik a molekulárně dynamických simulací.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
BO - Biophysics
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project focused on the study of signaling lipids and their membrane organization a lipid-binding proteins and their influence on the regulation of polar cell expansion in plants. The goals were fulfilled, resulting in seven impacted publications. Grant rules were satisfied.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 17, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
7,272 thou. CZK
Public financial support
7,272 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK