Study of plant virus propagation during sexual reproduction by light sheet microscopy
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
Promoting the mobility of researchers and workers in the framework of international cooperation in R&D
Call for proposals
—
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
MSMT-5501/2021-13
Alternative language
Project name in Czech
Studium propagace rostlinných virů v reprodukčních orgánech rostlin pomocí „light sheet“ mikroskopie
Annotation in Czech
1) Výběr rostlinných reportérových linií a značených virů pro mikorskopické zobrazování Zapojené laboratoře disponují celou řadou linií A. thaliana, které obsahují fluorescenční reportéry specifické pro různé typy buněk apikálního meristému a zárodečné dráhy. Tyto linie a jejich kombinace budou spolu se značenými viry testovány pomocí light sheet mikroskopie v Brně za účelem nalezení nejlepších kombinací pro studování antivirové meristematické bariéry. Toto empirické testování bude nezbytné, protože různé reportéry mohou vykazovat různé vlastnosti s ohledem na zobrazování pomocí light sheet mikroskopie (intenzita signálů, stabilita signálu). Dále bude důležité najít vývojová stádia i stádia infekce vhodná pro toto zobrazování. Dr. Incarbone bude zodpovědný za přípravu virů, jejich infikaci a sledování infekce. Příprava vzorků pro mikroskopii a optimalizace protokolu pro zobrazování budou prováděny Dr. Valuchovou a Dr. Mikulkovou. 2) Optimalizace přípravy vzorku a jejich zobrazování Velkou výzvou bude najít vhodné nastavení pro zobrazování a zároveň zajistit, že vzorek přežívá a chová se v rámci možností co nejblíže fyziologickým podmínkám. Infikované vzorky mohou mít netypický tvar a růst, a příprava takového materiálu bude vyžadovat empirické testování, abychom nalezli reprodukovatelné podmínky ke zobrazování. Složení kultivačního média a korekce posunu vzorku během zobrazování tak, aby byl co nejlépe zachycen vývoj biologického materiálu v čase, budou důležitými parametry, které budeme muset empiricky optimalizovat. Věříme ale, že s našimi několikaletými zkušenostmi s přípravou vzorku budeme schopni tyto podmínky relativně rychle zoptimalizovat. 3) Optimalizace zpracování obrazových dat Sledování infikovaných květů a meristémů v čase a v prostoru, bude produkovat velké množství dat a klást nároky na jejich analýzu, kterou bude konzultovat Dr. Valuchova.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10601 - Cell biology
OECD FORD - secondary branch
10607 - Virology
OECD FORD - another secondary branch
10611 - Plant sciences, botany
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EA - Morphology and cytology<br>EE - Microbiology, virology<br>EF - Botany
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project was implemented within the framework of the MOBILITY Activity, whose main objective is to establish and deepen contacts with foreign research institutions. Therefore, the partial outputs of the project are not checked by the evaluation committee, but the correctness of the use of the allocated funds and the adequacy of their use are checked.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2021
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 3, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-MSM-8J-U
Data delivery date
Jun 30, 2023
Finance
Total approved costs
126 thou. CZK
Public financial support
126 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK