Plant hormone cytokinin and its role in the production of secondary metabolites and establishing plant-microbe communication
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
Promoting the mobility of researchers and workers in the framework of international cooperation in R&D
Call for proposals
—
Main participants
Mendelova univerzita v Brně / Agronomická fakulta
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
MSMT-19178/2022-38
Alternative language
Project name in Czech
Role rostlinného hormonu cytokininu v tvorbě sekundárních metabolitů a formování komunikace mezi rostlinou a mikroorganismy
Annotation in Czech
1) Vliv modulace hladiny cytokininů na interakci A. thaliana s bakteriemi podporujícími růst. Pomocí transgenních linií a farmakologických přístupů umožňujících modulaci endogenní hladiny cytokininů budeme pozorovat efekt změny v homeostázi cytokininů na navození interakce mezi rostlinou a bakteriemi (např. Pseudomonas fluorescens nebo syntetická společenství). Změny budou sledovány na úrovni fyziologických parametrů, produkce sekundárních metabolitů a rostlinného lipidomu a proteomu včetně případných posttranslačních modifikací proteinů (např. fosforylace a modifikace histonů). 2) Vliv modulace hladiny cytokininů na interakci A. thaliana s patogenními bakteriemi. Navážeme na experimenty uvedené v předchozím bodě a doplníme je o interakce s patogenními bakteriemi (např. Burkholderia glumae). Výsledky fyziologických a molekulárních analýz z obou studií následně porovnáme a vyhodnotíme roli cytokininů. 3) Genetická analýza role signální dráhy cytokininů v biotických interakcích. Navážeme na získané výsledky a s využitím vybraných mutantů pokrývajících mutace v receptorech cytokininů a všech komponent jejich signální dráhy identifikujeme geny, které jsou klíčové pro komunikaci rostlin s mikroorganismy a vytvoření interakcí. Pomocí molekulárních analýz se budeme snažit odhalit efekt mutací na pozorované interakce. 4) Validace funkční významnosti identifikovaných proteinů. Funkci vybraných kandidátních proteinů (získaných v rámci prvních tří cílů) ověříme pomocí analýzy dostupných mutant v genech, které je kódují, a budeme rovněž sledovat jejich orthology v kulturních plodinách. Jejich role bude ověřena na základě schopnosti odpovídajících mutantních rostlin navázat prospěšný vztah nebo odolávat infekčnímu tlaku. Interakce bude sledována na úrovni fyziologické analýzy případně sledováním markerů biotického stresu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - secondary branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - another secondary branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology<br>EF - Botany
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2024
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-MSM-8J-R
Data delivery date
Feb 27, 2023
Finance
Total approved costs
380 thou. CZK
Public financial support
380 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK