Phoma stem canker, nonhost resistance, Arabidopsis thaliana, Brassica carinata, Leptosphaeria maculans, Leptosphaeria biglobosa

Provider

Ministry of Education, Youth and Sports

Programme

Promoting the mobility of researchers and workers in the framework of international cooperation in R&D

Call for proposals

—

Main participants

Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.

Contest type

M2 - International cooperation

Contract ID

MSMT-18714/2022-81

Project name in Czech

Odhalení komponent nehostitelské rezistence Arabidopsis thaliana a Brassica carinata k Leptosphaeria spp. pomocí celogenomové asociační studie

Annotation in Czech

Komplex druhů Leptosphaeria zahrnuje houby patogenní pro řepku olejku (Brassica napus). V rámci tohoto druhového komplexu je L. maculans hlavním původcem fomového černání stonků řepky. Vysoká adaptační schopnost L. maculans činí šlechtění na specifickou rezistenci obtížným a proto je důležité porozumět nespecifické kvantitativní rezistenci, která je považována za trvanlivější zdroj rezistence. L. maculans i L. biglobosa nejsou adaptovány na A. thaliana Col-0. L. maculans nedokáže infikovat ani B. carinata. A. thaliana a B. carinata jsou tak považovány za nehostitele L. maculans. Hlavním cílem tohoto projektu je zjistit společné a odlišné komponenty podílející se na nehostitelské rezistenci A. thaliana a B. carinata vůči L. maculans a/nebo L. biglobosa. S využitím sady ekotypů A. thaliana (187) (1001 Genomes Consortium, 2016) budou identifikovány složky, které jsou základem rezistence nebo susceptibility k těmto druhům Leptosphaeria. Tento projekt bude těžit z dalšího projektu řešeného jedním ze spolupracovníků (INRAE BIOGER) zaměřeného na pochopení nehostitelské rezistence) u B. carinata. Inokulace ekotypů A. thaliana patogeny Leptosphaeria spp. povede k vytvoření skupin ekotypů charakterizovaných specifickými interakcemi mezi rostlinou a patogenem od nehostitelské po susceptibilní reakci. Vybrané ekotypy budou charakterizovány a identifikovány genové lokusy související s odlišnými fenotypovými skupinami. Profily genové exprese kandidátních genů u B. napus a B. carinata infikovaných L. maculans nebo L. biglobosa umožní identifikovat determinanty rezistence nebo susceptibility u těchto rostlinných druhů. Odhalení podstaty nehostitelských interakcí mezi A. thaliana a B. carinata k L. maculans a L. biglobosa poslouží jako základ pro objasnění klíčových determinant NHR také u dalších ekonomicky významných druhů rostlin z čeledi Brassicaceae a přinese cenné informace potřebné pro šlechtění na rezistenci k fomovému černání stonků.

R&D category

ZV - Basic research

OECD FORD - main branch

10611 - Plant sciences, botany

OECD FORD - secondary branch

10608 - Biochemistry and molecular biology

OECD FORD - another secondary branch

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)

CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology<br>EF - Botany

Provider evaluation

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Project results evaluation

This project was being realized in the framework of the MOBILITY Activity that aims primarily on establishing and strenghtening ties with foreign research institutions. The control of particular outputs is not implemented by the evalution committee, but the correctness of allocated finances and the adequacy of their use are checked.

Realization period - beginning

Jan 1, 2023

Realization period - end

Dec 31, 2024

Project status

U - Finished project

Latest support payment

Feb 10, 2024

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP25-MSM-8J-U

Data delivery date

Jun 27, 2025

Total approved costs

156 thou. CZK

Public financial support

156 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK