Structural characterization of NuA4 with a nonhistone acetylation target
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
Promoting the mobility of researchers and workers in the framework of international cooperation in R&D
Call for proposals
—
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
MSMT-4361/2024-5
Alternative language
Project name in Czech
Strukturní charakterizace NuA4 s nehistonovým acetylačním cílem
Annotation in Czech
V posledních letech bylo publikováno několik dílčích nebo úplných struktur NuA4, včetně struktury s navázaným nukleosomem – přirozeným substrátem tohoto multiproteinového komplexu. NuA4 hraje roli i v mnoha dalších buněčných procesech, ale mechanismus jakékoli jiné interakce dosud není znám. Předmětem předkládaného projektu je právě studium těchto interakcí a snaha o prokázání skutečnosti, zda je povrch pro vazbu dalších proteinů k acetylaci stejný nebo částečně jiný a jaký je mechanismus jejich rozpoznávání. Spolupráce je založena na vzájemném přenosu zkušeností francouzského a českého týmu. Projekt je celkem rozdělen do pěti dílčích cílů, přičemž první bude probíhat na ÚOCHB, druhý na IGBMC, třetí paralelně na obou pracovištích a čtvrtý a pátý na IGBMC. Za dílčí cíle projektu považujeme: 1) optimalizaci rekombinantní přípravy nehistonového acetylačního cíle, 2) izolaci endogenního enzymatického komplexu NuA4, 3) ověření enzymatické aktivity acetylačním testem, 4) přípravu vzorku navázaného NuA4 s acetylačním cílem pro Cryo-EM, 5) určení třídimenzionální struktury pomocí Cryo-EM a definování klíčových faktorů pro rozeznávání různých cílů enzymatické aktivity. V rámci předkládaného projektu si tímto klademe za cíl plně rozvinout spolupráci s renomovanými odborníky z jednotky Integrativní strukturní biologie na IGBMC ve Francii a podpořit rozvoj vědecké kariery mladých vědců z obou spolupracujících zemí. Nedílnou součástí tohoto projektu je přenos vědecké expertízy a zapojení doktorských studentů. Český tým velmi dobře ovládá přípravu rekombinantních proteinů včetně jejich rychlé a přesné biofyzikální charakterizace pomocí NMR. Součástí francouzského týmu jsou odborníci v oblasti práce s endogenními vzorky a určování trojrozměrné struktury s využitím Cryo-EM. Oba týmy se vzájemně obohatí v různých oblastech, což je klíčové pro nastávající projekty v rámci obou institucí.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2025
Realization period - end
Dec 31, 2026
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-MSM-8J-R
Data delivery date
Feb 11, 2025
Finance
Total approved costs
157 thou. CZK
Public financial support
157 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK