A methodology for the determination of zoological collection specimens on the basis of DNA analysis and the management of tissue samples collection
Public support
Provider
Ministry of Culture
Programme
Programme for the Support of Applied Research and Exp. Development of National and Cultural Identity dor the Years 2016-2022 (in short, "NAKI II")
Call for proposals
NAKI II 1 (SMK02016DG001)
Main participants
Národní muzeum
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
38/2016/OVV
Alternative language
Project name in Czech
Metodika determinace zoologického sbírkového materiálu na základě analýzy DNA a správy a evidence tkáňové zoologické sbírky
Annotation in Czech
Základním cílem předkládaného projektu aplikovaného výzkumu je navržení a zavedení jednotné metodiky určování zoologického sbírkového materiálu (tzn. určování jedinců do biologického druhu, případně poddruhu) na základě čtení krátkých sekvencí DNA (tzv. DNA barcoding), jež zlepší možnosti determinace sbírkových exemplářů, a přispěje tak ke zhodnocení tohoto typu movitého kulturního dědictví. Zaměříme se na identifikaci ideálních kandidátních genetických markerů napříč fylogenetickým spektrem živočišné říše. Zvláštní zřetel bude nicméně věnován druhům zasahujících svým rozšířením na území ČR, jelikož představují nevýznamnější a z kulturního hlediska nejcennější část lokálních sbírkových fondů. Součástí projektu bude vytvoření tkáňové sbírky, ve které budou uchovávány vzorky zoologického materiálu. Definujeme metodická pravidla pro odebírání tkáňových vzorků z různých typů zoologických exemplářů tak, aby se maximalizovala výtěžnost extrakce DNA a minimalizovala invazivnost odběru. Zároveň vytvoříme jednotnou metodiku správy sbírky obdobného charakteru (dokumentace, konzervace), pravidla zacházení s tkáňovými vzorky a jejich poskytování odborné veřejnosti k výzkumným účelům. Veřejnost bude seznámena s moderními genetickými přístupy v biologických a forenzních vědách formou odborných publikací, metodického manuálu a výstavy. Význam navrhovaných metodických postupů pro zhodnocení zoologických sbírek je nesporný, neboť budou aplikovatelné pro determinaci fragmentovaného nebo poničeného materiálu, materiálu neznámého původu, nedospělých vývojových stadií postrádajících určovací znaky nebo živočišných výrobků ve všech institucích disponujících zoologickými sbírkami v celé České republice (lokální muzea, zoologické zahrady, soukromé sbírky). Vypracování metodiky odebírání tkáňových vzorků a sekvenace DNA z materiálu zoologických sbírek napomůže k ochraně a uchování hodnot významné složky kulturního dědictví ČR a zvýšení vědeckého potenciálu našich sbírkotvorných pracovišť.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
CEP classification - main branch
AL - Art, architecture, cultural heritage
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
20103 - Architecture engineering<br>60401 - Arts, Art history<br>60402 - Architectural design<br>60403 - Performing arts studies (Musicology, Theater science, Dramaturgy)<br>60404 - Folklore studies<br>60405 - Studies on Film, Radio and Television
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Main goal of this project was to design and apply unified methodology regarding determination of zoological collection (identification of biological species or subspecies) from reading of short DNA sequences (DNA barcoading), which contributed to improved ability of determination of specimen collection and to evaluation of this type of movable cultural heritage. It was proven, that designed methodology is fully functional even in harsh climatic conditions. On the other, problem arose in extraction of usable genetic material from older collections or rather their practical inapplicability due to contamination and rough conservation methods. 100% of main results were achieved and 120% of secondary results were achieved. Project is thus evaluated as „Successful“.
Solution timeline
Realization period - beginning
Mar 1, 2016
Realization period - end
Dec 31, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 26, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-MK0-DG-U/03:1
Data delivery date
May 18, 2021
Finance
Total approved costs
17,215 thou. CZK
Public financial support
16,902 thou. CZK
Other public sources
271 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK