BBMRI-CZ: Biobank network - a versatile platform for the research of the etiopathogenesis of diseases
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
—
Call for proposals
—
Main participants
Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta
Contest type
OP - EU Operational Programme
Contract ID
16_013/0001674_01
Alternative language
Project name in Czech
BBMRI-CZ: Síť biobank - univerzální platforma k výzkumu etiopatogeneze chorob
Annotation in Czech
Projekt je zaměřen na prospektivní sběr a výzkum vzorků připravovaných v rámci sítě biobank lidského biologického materiálu sdružených v infrastruktuře BBMRI-CZ. Projekt povede k rozšíření spektra vzorků, zefektivnění postupů přípravy a dlouhodobého uchování vzorků (preanalytická fáze). Zásadním přínosem bude výzkum etiopatogeneze širokého spektra nádorových onemocnění i socioekonomicky závažných nenádorových chorob z různých oblastí medicíny (gastroenterologie, kardiologie, oftalmologie).
Scientific branches
R&D category
IF - RDI infrastructure
CEP classification - main branch
FE - Other fields of internal medicine
CEP - secondary branch
FA - Cardiovascular diseases including cardio-surgery
CEP - another secondary branch
FH - Neurology, neuro-surgery, nuero-sciences
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
30103 - Neurosciences (including psychophysiology)<br>30201 - Cardiac and Cardiovascular systems<br>30210 - Clinical neurology<br>30217 - Urology and nephrology<br>30218 - General and internal medicine<br>30219 - Gastroenterology and hepatology<br>30220 - Andrology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The number and spectrum of samples from cancer (kidney, prostate) and non-cancer diseases (cardiology, ophthalmology) were increased within the project. The pre-analytic phase was standardized and optimized (influence of tissue fixation methods on sample yield, isolation of tumor DNA from plasma, verification of tumor marker’s stability, standardization of exome germline, and massively parallel sequencing). Databases for information about samples and accompanying data were innovated in two biobanks. Obtained samples were used to characterize the molecular processes of carcinogenesis (DNA methylation), cancer development, and the interaction between the tumor and the immune system. Studies on mechanisms of etiopathogenesis of endometrial and ovarian cancers, malignancies of the lungs, kidneys, bladder, pancreas, colorectal, oropharyngeal, and sinonasal carcinomas have been published. The monitored biomarkers were HNF1, hrHPV, VEGF and BRCA, CD147, APOA4.
Solution timeline
Realization period - beginning
Oct 1, 2017
Realization period - end
Mar 31, 2020
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Oct 14, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-MSM-EF-U/01:1
Data delivery date
Jun 25, 2021
Finance
Total approved costs
38,611 thou. CZK
Public financial support
38,611 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK