Characterization of elite breeding lines and germplasm of wheat and barley using DNA fingerprinting based on AFLP and microsatellites

Provider

Ministry of Agriculture

Programme

—

Call for proposals

—

Main participants

Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i.

Contest type

VS - Public tender

Contract ID

—

Project name in Czech

Charakterizace elitních šlechtitelských materiálů a genofondů pšenice a ječmene pomocí DNA fingerprintingu na bázi AFLP a mikrosatelitů

Annotation in Czech

Cílem předkládaného projektu je navrhnout model přípravy "core" kolekce genových zdrojů samosprašných obilovin na základě molekulárních markerů (zjm. AFLP a mikrosatelitů). Na souboru 40 odrůd pšenice a ječmene bude testována schopnost mikrosatelitních aAFLP markerů detekovat polymorfismus na úrovni DNA. Nejvhodnější kombinace primerů budou využity pro analýzu 400 odrůd a linií jak moderních tak starších krajových odrůd a cenných novošlechtění českého i evropského sortimentu. Bude stanovena relativní genetická diverzita v rámci tohoto souboru. Data získaná z DNA analýz budou korelována s popisnými pasportními daty, bude provedena analýza rodokmenů a na těchto základech navržen způsob odvození "core" kolekcí, které představují efektivní a ekonomický způsob uchovávání genových zdrojů. Současně bude připraven katalog DNA fingerprintingů (a) moderních českých odrůd a vybraných novošlechtění jako etalon pro jejich právních ochranu, kontrolu pravosti a čistoty osiva, (b) cenných krajových odrů

R&D category

—

CEP classification - main branch

GE - Plant cultivation

CEP - secondary branch

EB - Genetics and molecular biology

CEP - another secondary branch

—

OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Provider evaluation

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Project results evaluation

Projekt naplnil své zadání. Byly vypracovány techniky DNA analýz (AFLP, mikrosatelity) a zhodnocena kolekce odrůd ječmene a pšenice. Byl navržen způsob využití DNA markerů při tvorbě core kolekcí. Výsledky byly publikovány.

Realization period - beginning

Jan 1, 1999

Realization period - end

Jan 1, 2002

Project status

U - Finished project

Latest support payment

—

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP/2003/MZE/MZE3QA/U/N/3:1

Data delivery date

Oct 23, 2003

Total approved costs

3,606 thou. CZK

Public financial support

2,884 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

722 thou. CZK