Computational study of interactions of organic matter and biomolecules with mineral surfaces
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Main participants
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-08651S
Alternative language
Project name in Czech
Počítačové modelování interakcí organické hmoty a biomolekul s minerálními povrchy
Annotation in Czech
Projekt je zaměřen na počítačové modelování interakcí organických molekul (přírodních organických hmot, polycyklických aromatických uhlovodíků), biomolekul (stavebních bloků DNA) a směsí rozpouštědel s minerálními povrchy s důrazem na ekologicky a technologicky důležité systémy. Interakce těchto molekul s povrchy tvořenými křemenem a rutilem budou studovány pomocí molekulární mechaniky, molekulární dynamiky a ab initio výpočetními metodami pro různé povrchové hustoty náboje povrchů, které odpovídají rozmezí hodnot pH za podmínek experimentu či v přírodních procesech. Ze simulací budou získány struktury adsorbovaných komplexů, termodynamické vlastnosti, tj. interakční energie, volné energie a adsorpční izotermy vzniklých komplexů a dále budou identifikovány nejvýznamnější typy interakcí v komplexech a vliv jednotlivých atomů a funkčních skupin na jejich stabilitu. Výsledky našich simulací budou porovnány s experimentálními daty, a to jak se stávajícími, tak s výsledky probíhajícího výzkumu našich spolupracovníků zabývajících se experimenty.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10403 - Physical chemistry
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
This relatively small 4-years project delivered a number of results in the field of modeling of surfaces as well as in methodology. The report is thorough. The topics are environmentally motivated, although no direct applications are expected. Participation of students is appreciated. 11 papers in high-quality journals were published. To summarize, sound and high-quality research has been done.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 12, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
3,570 thou. CZK
Public financial support
3,570 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK