Insights into protein structure from polarization fluorescence microscopy
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Main participants
Centrum výzkumu globální změny AV ČR, v. v. i.<br>Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-10799S
Alternative language
Project name in Czech
Výzkum struktury proteinů prostřednictvím polarizační fluorescenční mikroskopie
Annotation in Czech
Optické vlastnosti fluorescentních proteinů (FP) jsou anisotropické, čehož lze využít při vývoji a použití řady geneticky kódovaných fluorescentních sond biologických procesů. Anisotropie FP však také může (prostřednictvím polarizační mikroskopie) poskytovat informace o struktuře proteinů, přímo v živých buňkách. Tato možnost je však v současnosti neprozkoumána. Navrhujeme proto tuto mezeru zaplnit otestováním hypotézy, že polarizační mikroskopii lze využít k určení orientace FP vůči jiným částem fúzního proteinu. Abychom toho dosáhli, tak 1) určíme orientaci dipólových momentů přechodu (DMP) vůči buněčné membráně u membránových proteinů značených pomocí FP; 2) určíme směr DMP v molekulách významných FP; 3) určíme orientaci FP v konstruktech na bázi membránových proteinů a porovnáme ji s dostupnými strukturními daty. Naše výsledky poskytnou základní informace o fluorescentních proteinech, umožní zlepšení současných geneticky kódovaných fluorescentních sond, a přispějí k vývoji nových nástrojů pro získávání strukturních informací o proteinech.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
BO - Biophysics
CEP - secondary branch
ED - Physiology
CEP - another secondary branch
CE - Biochemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>30105 - Physiology (including cytology)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project was focused at the development the capabilities of polarization fluorescence microscopy to provide information on structure of membrane proteins. Both overall and specific aims have largely been achieved. The results were published in 5 articles in impact journals. The funds have been spent in accord with the approved budget. The project also led to awarding of EU patent.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Apr 23, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 17, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GA-U/05:1
Data delivery date
Jun 25, 2019
Finance
Total approved costs
7,182 thou. CZK
Public financial support
7,182 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK