Towards the understanding of the CTD code of RNA Polymerase II
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-18344S
Alternative language
Project name in Czech
Studium kódu CTD RNA polymerázy II
Annotation in Czech
Navrhuji objasnit základní pravidla, která používají RNA procesující faktory pro rozpoznávání tzv. CTD kódu RNA polymerázy II. Koncept CTD kódu, který určuje pozici RNA polymerázy v transkripčním cyklu a řídí interakce se specifickými procesujícími faktory byl navrhnut téměř před 10 lety. Snaha odhalit strukturu CTD a její interakce s četnými vazebnými faktory byla neúspěšná v předchozích krystalografických pokusech z důvodu flexibility CTD a její slabé vazebné afinitě k procesujícím faktorům. V tomto projektu určíme NMR struktury několika procesujících faktorů navázaných na CTD s různými modifikačními značkami. Nedávný vývoj v oblasti SAXS technik, které lze nyní kombinovat s vysoce rozlišenými NMR strukturami, nám umožní objasnit dlouhodobou otázku jak vazba procesujících faktorů mění strukturu CTD. Použití této technologie poskytne zcela nové strukturní informace k objasnění CTD kódu, což významně posune hranice poznání v oboru transkripce a procesování RNA.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Significant results which meet criteria of excellent research, demonstrated by publications in high profiled journals. Important contribution to our understanding of the CTD RNA II code.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Dec 31, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
May 4, 2018
Finance
Total approved costs
12,739 thou. CZK
Public financial support
12,739 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK