3-Nitro-L-tyrosine in structures of neurodegenerative proteins
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 18 (SGA0201400001)
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
14-00431S
Alternative language
Project name in Czech
3-Nitro-L-tyrosin ve strukturách neurodegenerativních proteinů
Annotation in Czech
Vliv oxidativního stresu na strukturu neurodegenerativních proteinů bude studován na chemických modelech s využitím kombinace chiroptických spektroskopií a teoretických výpočtů spekter. Jeden z důsledků oxidativního stresu je modifikace tyrosinu na 3-nitro-L-tyrosin v proteinech. Tato modifikace výrazně mění hydrofobní a acidobazický charakter aminokyselinového zbytku. Ovlivní-li modifikace sekundární strukturu, může ovlivnit i propuknutí neurodegenerativních onemocnění, která jsou způsobena změnami konformace proteinů. Vybranými molekulami pro studium konformačních změn jsou modely odvozené od prionového proteinu a alfa-synukleinu. První z nich se uplatňuje při transmisivní spongiformní encefalopatii a druhý při Parkinsonově nemoci. Získaná spektroskopická data budou korelována se schopností nitrovaných proteinů agregovat a tvořit amyloidní fibrily. Pro látky s nízkou rozpustností (amyloidní proteiny) se pro spektroskopické experimenty využijí techniky pro amplifikaci signálu založené na povrchově zesílených jevech na stříbrných a zlatých nanočásticích.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10403 - Physical chemistry
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project results shown that nitration of tyrosine significantly altered reactivity and lipophilic character of studied neurodegenerative protein models. The methodology for measurement of Raman spectra of nitrated proteins based on signal enhancement on silver nanoparticles, which enables determination of extent of protein tyrosine nitration, was developed. 4 papers were published journals.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2014
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
4,344 thou. CZK
Public financial support
4,344 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK