Evolution, diversification and biogeography of polyploid Zingiberaceae: synergy of phylogenomics, cytogenomics, geological and climate history
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 18 (SGA0201400001)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut<br>Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
14-13541S
Alternative language
Project name in Czech
Evoluce, diversifikace a biogeografie polyploidní čeledi Zingiberaceae: synergie fylogenomiky, cytogenomiky, geologické a klimatické historie
Annotation in Czech
Zázvorovité (Zingiberaceae) jsou ekonomicky významnou tropickou čeledí rostlin rozšířenou především v jihovýchodní Asii a částečně v Africe a jižní Americe zahrnující přibližně 50 rodů. Aplikací moderních NGS fylogenomických technik (tzv. hybridization-based enrichment a genome skimming) budou získány sekvence celých chloroplastů a několika stovek jaderných genů pro stovky druhů, které budou použity pro vytvoření robustní a dobře rozlišené fylogeneze čeledi. Ta bude kalibrována pomocí fosilního záznamu. Kombinace získané genomické informace a cytogenomické údaje budou použity pro odhad počtu a datování polyploidizačních událostí během evoluce. Kalibrovaná fylogeneze také umožní rekonstruovat vývoj biogeografického pattern zázvorovitých.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EF - Botany
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project focused to shed the light onto very complex relationships within the tropical family Zingiberaceae was successfully fulfiled . All aims of the project were done and publish in the eight papers and some MS is for publishing. The rules of the CSF were followed.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2014
Realization period - end
Dec 5, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 4, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jun 12, 2019
Finance
Total approved costs
10,544 thou. CZK
Public financial support
10,544 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK