Emergence of pathogenicity for vertebrates: insight from ancestral bodonids and insect trypanosomatids
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 18 (SGA0201400001)
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
14-23986S
Alternative language
Project name in Czech
Vznik patogenity pro obratlovce: vhled diky puvodnim bodonidum a hmyzim trypanosomatidum
Annotation in Czech
Hlavním cílem tohoto projektu je určit změny v genomu, které vedly ke změně monoxenního (=jednohostitelského) životního stylu hmyzích trypanosomatid k dixennímu (=dvouhostitelskému) parasitismu, charakteristického pro zástupce rodů Trypanosoma, Phytomonas a Leishmania, kteří jsou zodpovědní za závažné choroby rostlin a obratlovců včetně člověka. K tomuto účelu budeme sekvenovat, skládat a anotovat několik genomů bičíkovců reprezentujících diverzitu monoxenních hmyzích trypanosomatidů a rovněž trypanozomám blízce příbuzného druhu Paratrypanosoma. Chceme vytvořit inducibilní systém interference RNA a nadprodukce bílkovin v Leptomonas pyrrhocoris, a tento systém následně použijeme ke studiu funkce genů (zejména těch kódujících mitochondriální bílkoviny) specifických buď pro monoxenní nebo dixenní parazity, jejichž příkladem je kataláza. Použití nejnovějších sekvenačních technologií nám umožní studovat (alternativní) editování mitochondriálních RNA, se zaměřením na úseky nekódující bílkoviny v časně se větvícím bodonidovi Perkinsela.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project substantially contributed to our understanding of the evolutionary roots of parasitic kinetoplastid flagellates, including human and mammalian parasites (Trypanosoma, Leishmania). Results were published in top quality scientific journals and already achieved an impressive number of citations. Despite minor formal errors, the project produced excellent outputs, given its modest budget.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2014
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
3,590 thou. CZK
Public financial support
3,590 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK