Hidden relevant functional pathways in host response to Leishmania infection revealed in focused genomic constructions
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 18 (SGA0201400001)
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
14-30186S
Alternative language
Project name in Czech
Skryté relevantní funkční dráhy v odpovědi hostitele na infekci Leishmania zjištěné pomocí cílených genomických konstruktů
Annotation in Czech
Leishmaniáza je prototypem infekční choroby charakterizované množstvím různých symptomů a velkou individuální variabilitou. Pro objasnění molekulárních drah (pathways) určujících tuto variabilitu jsme použili myší kmeny CcS, které nesou různé soubory 12.5% genů odolného kmene STS na genetickém pozadí vnímavého kmene BALB/c. U kmene CcS-20 jsme překvapivě nalezli několik nových regulačních drah, jejichž expresní profily nebyly nalezeny mezi profily rodičovských kmenů. Podobné neaditivní dráhy odlišné od drah rodičovských kmenů by mohly existovat i u ostatních CcS kmenů. To ukazuje, že individuální expresní profily nelze jednoduše odvodit z geneticky složitějších situací. Pomocí integrace expresních genových profilů s geny pro citlivost k infekci a s výsledky imunologických a metabolických testů určíme a ověříme funkční genetické sítě odpovědi k infekci ve slezinách a v makrofázích a nalezneme kritické regulační spouštěče, které určují individuální vnímavost k onemocnění. Získané výsledky poskytnou kvalitativně nový pohled na regulaci imunitního systému při infekci.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EC - Immunology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
EE - Microbiology, virology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30102 - Immunology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Three papers related to the project topics have been published, out of which the recent publication in the prestigious journal Frontiers in Immunology is the project “flagship” paper. Other submitted paper and accepted patent are only partially related to the project. Regarding the overlap of publications with the P.I.’s follow-up project, this project could be evaluated only as accomplished.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2014
Realization period - end
Apr 23, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jun 12, 2019
Finance
Total approved costs
5,978 thou. CZK
Public financial support
5,978 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK