Phylogenetic establishment of cyanobacterial genera through multilocus of the generitypes
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 19 (SGA0201500001)
Main participants
Botanický ústav AV ČR, v. v. i.<br>Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
15-11912S
Alternative language
Project name in Czech
Fylogenetické vymezení rodů sinic pomocí multilokusové analýzy typových druhů
Annotation in Czech
Předkládaný projekt poskytne rámec modernímu taxonomickému systému sinic, který bude založen na multilokusové fylogenetické analýze typových (nebo typických) druhů klasických i recentně popsaných rodů sinic. Typové druhy evropských rodů budou sbírány na typových lokalitách, nebo na lokalitách identického charakteru blízko lokalit typových. Budeme se pokoušet izolovat nové kmeny typových druhů a simultánně provádět amplifikaci jejich celých genomů (WGA). PCR genů pro 16S rRNA, 16S-23S ITS regionu, 23S rRNA, rpoC1, rbcLX a rpoB bude prováděna z přírodních izolátů, nebo produktu WGA. U organizmů, které představují dosud neznámé vývojové linie budeme vytvářet drafty genomových sekvencí, které budou získány buď s použitím produktu WGA nebo genomické DNA z kmenů. Rovněž použijeme rozsáhlý soubor kmenů námi recentně popsaných rodů pro získání sekvencí výše zmíněných genů a současně využijeme rostoucí počet dostupných genomů k rozšíření souboru zkoumaných taxonů. Získaná data nám umožní fylogenetickou analýzu většiny rodů sinic na úrovni celých genomů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EF - Botany
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project objective was the revision of the cyanobacteria taxonomy and their phylogenetic relationships. The final report is written in a clear manner, the project progressed according to the plan, the main objectives were met and the project results were published in 14 impacted publications (two did not contain the dedication). Five more publications are in press. The project was fulfilled.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2015
Realization period - end
Dec 31, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 27, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
May 4, 2018
Finance
Total approved costs
9,301 thou. CZK
Public financial support
9,301 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK