Theoretical Study of Photosyntetic Processes in Photosystem II
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 19 (SGA0201500001)
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
15-12816S
Alternative language
Project name in Czech
Teoretické studium fotosyntetických procesů ve fotosystému II
Annotation in Czech
Konformační změny v reakčním centru fotosystému II (PSII RC) budou zkoumány pomocí simulací molekularní dynamiky (MD), založené na použití polarizovaných atomových nábojů získaných z QM/MM výpočtů a metody indukovaných nábojů. Rychlostní konstanty přenosu elektronu mezi kofaktory fotosystému II, které se účastní přenosu elektronu, budou vypočteny pomocí vícestupňové metody, která kombinuje MD simulace a ab inito výpočty. Teto metoda bude ověřena srovnáním z experimentálními výsledky, popisující hlavní větev přenosu elektronu D1 ve fotosystému II. Rovněž bude spočítán časový průběh přenosu elektronu podél hlavní větve D1, jakož i postranních drah elektronových přenosů, které procházejí cytochromem b559. Výsledky poskytnou detailní mechanismus přenosu elektronu v průběhu fotosyntézy v PSII RC.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
BO - Biophysics
CEP - secondary branch
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10403 - Physical chemistry<br>10610 - Biophysics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Based on computational modelling the project contributed to our knowledge of photosystem II (PSII) dynamics, mechanisms of charge transfer in PSII reaction center (RC) and charge transfer between PSII RC cofactors. One paper was published in Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy (IF ca 2,9), however main results were not published till now.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2015
Realization period - end
Nov 29, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 17, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
Jul 23, 2020
Finance
Total approved costs
2,007 thou. CZK
Public financial support
2,007 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK