Influence of conformation motifs and epigenetic modifications to DNA binding properties of p53 family proteins
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 19 (SGA0201500001)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
15-21855S
Alternative language
Project name in Czech
Vliv konformačních motivů a epigenetických modifikací na DNA vazebné vlastnosti proteinů rodiny p53
Annotation in Czech
Změny epigenetických modifikací jsou typickým rysem u mnoha běžných onemocnění člověka včetně nádorové transformace. Metylace DNA, deacetylace a metylace histonů jsou často asociovány s neaktivním stavem chromatinu a utlumením genové exprese. V našem projektu budeme studovat vliv epigenetických modifikací a lokálních struktur (křížových struktur, triplexů a kvadruplexů) DNA na interakce proteinů rodiny p53 (p53, p63 a p73) s DNA. Provedeme systematickou studii komplexů DNA od biochemických studií in vitro, po jejich lokalizaci na buněčné úrovni. Znalosti získané z připravované studie nám umožní lepší pochopení toho, jak jsou interakce proteinů s DNA regulovány postranslačními modifikacemi a lokálními strukturami v DNA a rozšíří tak naše pochopení molekulárních základů vzniku nádorů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
FD - Oncology and haematology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Within this research project, we analyzed the p53 family proteins binding to DNA in detail. The analyses of their binding to topologically constrained non-B DNA structures including cruciform, triplex and quadruplex DNAs were provided. Project solution is rated as excellent.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2015
Realization period - end
Dec 31, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
May 4, 2018
Finance
Total approved costs
6,795 thou. CZK
Public financial support
6,795 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK