Molecular modulation of cytokinin metabolism in model plants Physcomitrella and maize focused on function of nucleosidases
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 19 (SGA0201500001)
Main participants
Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta<br>Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
15-22322S
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární modulace metabolismu cytokininů v modelových rostlinách Physcomitrelly a kukuřice se zaměřením na funkci nukleosidas
Annotation in Czech
Nukleosidy se objevují jako meziprodukty v metabolismu nukleotidů a rostlinných hormonů cytokininů, jež regulují buněčné dělení a velký počet vývojových dějů. Jsou hydrolyzovány nukleosid-N-ribohydrolasami (NRH), umožňující recyklaci nukleových bazí a ribózy. Ve dvou modelových rostlinách čepence (Physcomitrella) a kukuřici se nachází tři, respektive pět NRH genů. Cílem tohoto projektu je objasnit vliv NRH na metabolismus purinů/pyrimidinů a na aktivaci cytokininů vytvořením vícenásobných knockout mutantů v čepence a kukuřici, vytvořením linií nadprodukujících kukuřičné NRH v Arabidopsis a analýzou fenotypových a metabolických změn. Našim cílem je vývoj a optimalizace metody pro kvantifikaci purinových a pyrimidinových derivátů pomocí UPLC-MS/MS, objasnění katalýzy, a mapování reziduí zapojených do rozpoznání substrátu v aktivním místě enzymů, a to pomocí krystalografie a místně řízená mutageneze. Získané výsledky nám umožní porozumět fyziologickým úlohám NRH a hledat jejich možná propojení s enzymy metabolismu cytokininů a aldehyddehydrogenasami.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
CB - Analytical chemistry, separation
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10406 - Analytical chemistry<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Within the project were tested and optimized methods for purine and pyrimidine analysis in combination with cytokinine analyses. There were prepared and analyzed crystal structures of different proteins involved in cytokine metabolism. The results of the project include two patents and ten publications. Another manuscript is under preparation.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2015
Realization period - end
Dec 31, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
May 4, 2018
Finance
Total approved costs
6,119 thou. CZK
Public financial support
6,119 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK