Genetic Control of Genome-Wide Meiotic Recombination Rate and Homolog Recognition
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 20 (SGA0201600001)
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-01969S
Alternative language
Project name in Czech
Genetická kontrola celogenomové meiotické rekombinace a rozpoznání homologů
Annotation in Czech
S využitím "forward genetics" přístupu budeme zkoumat vztah meiotické rekombinace a genové konverze k synapsi homologních chromozomů na modelu vnitro- a mezi-poddruhových konsomických kmenů myší. Sledovanými fenotypy budou rekombinační noduly mismatch repair proteinu MLH1, SNP v oblastech genové konverze, nebo osy asynaptických chromozomů označené HORMAD2 proteinem. Divergence dvou myších poddruhů nám poprvé umožní mapovat místa v genomu odpovědná za rozpoznání a synapsi homologů v pachytenním stadiu meiozy. Pozičním klonováním identifikujeme sex-specifický a X-vázaný gen, který modifikuje celogenomovou frekvenci genetické rekombinace, a objasníme jeho vztah k meiotické synapsi. Pro sledování vlivu sekvenční divergence na genovou konverzi budeme srovnávat oblasti genových konverzí a jejich lokalizací v genomech mezi- a vnitro-druhových konsomických myší. Získané poznatky přispějí k lepšímu pochopení základních mechanizmů savčí meiozy a jejich úlohy v gametogenezi.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Grant project evaluating role of Prdm9 protein and Hstx2 locus on X chromosome in relation to hybrid sterility, recombination rate and chromosome synpasis. Results are publication in prestegious journals. In total six top class are documented, from those 3 with dedication to the project.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Nov 29, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 24, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jul 2, 2020
Finance
Total approved costs
6,349 thou. CZK
Public financial support
5,827 thou. CZK
Other public sources
522 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK