Distribution of biomolecules studied on single cell and subcellular levels in Xenopus early stages to reveal mechanisms of asymmetric cell divisio
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 20 (SGA0201600001)
Main participants
Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-07500S
Alternative language
Project name in Czech
Distribuce biomolekul studovaná v jednotlivých buňkách a vnitrobuněčně u časných stádií drápatky pro objasnění mechanismu asymetrického dělení
Annotation in Czech
Asymetrické dělení je základní vlastností buněk charakteristickou pro vyšší formy života. Přes jeho důležitost je mechanismus stale nejasný. Asymetrie buněk je způsobená polarizací faktorů určujících buněčný osud, které jsou nerovnoměrně distribuovány do dceřinných buněk. Nyní je známo pouze několik takových faktorů. Drápatka je ideálním modelem pro stadium asymetrického dělení buněk díky značné velikosti vajíček a časných buněk. My jsme vyvinuli techniku pro měření distribuce kritických biomolekul v rámci vývoje. Tento unikátní přístup bude použit pro měření distribuce kódujících a nekódujících RNA a take proteinů v rámci vajíčka až po 16-ti buněčná embrya. Vytvoříme první 3-dimensionální mapu časové exprese s jednobuněčným a dokonce vnitrobuněčným rozlišením tří typů biomolekul, které jsou kritickými faktory pro určení buněčného osudu v rámci animálně-vegetativní, dorsálně-ventrální a pravo-levé asymetrie.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project had three aims and all of them were met successfully. The most important result is complete transcriptomic and proteomic analyses of Xenopus laevis eggs followed by extensive bioinformatics analysis of the UTR regions. It is the first publication describing a new group of localized RNAs called extremely animal, which are putative regulators of ectoderm development.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Dec 31, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 25, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jun 12, 2019
Finance
Total approved costs
6,273 thou. CZK
Public financial support
6,171 thou. CZK
Other public sources
102 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK