Chromosome genomics of Agropyron cristatum, a wild relative of wheat
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 20 (SGA0201600001)
Main participants
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-16992S
Alternative language
Project name in Czech
Chromosomová genomika Agropyron cristatum, planého příbuzného pšenice seté
Annotation in Czech
Plané druhy rostlin se vyznačují značnou genetickou variabilitou a jsou potenciálním zdrojem nových genů pro šlechtění zemědělských plodin. Využití tohoto potenciálu je však komplikováno omezenou znalostí struktury genomů a nedostatkem metod pro rychlou a spolehlivou identifikaci přeneseného chromatinu. Tento projekt poskytne nové poznatky o struktuře genomu planého příbuzného druhu pšenice, Agropyron cristatum, a vytvoří molekulární nástroje, které umožní jeho využití ve šlechtění pšenice seté. Chromosomy izolované pomocí průtokové cytometrie budou sekvenovány metodami nové generace a budou získány poznatky o molekulární struktuře chromozomů a vytvořeny virtuální mapy genů. Získané informace usnadní přístup ke genům důležitého příbuzného pšenice, urychlí mapování důležitých znaků a umožní detailní komparativní analýzy struktury a evoluce chromozomů v rámci čeledi Poaceae. Získané poznatky budou významné pro základní výzkum zabývající se změnami genomů rostlin v průběhu evoluce a speciace a rovněž podstatně rozšíří možnosti využití přenosu genů z planých druhů ve šlechtění pšenice.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
GE - Plant cultivation
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project has brought new knowledge about the structural genomics of Agropyron cristatum that could be utilized in wheat breeding. The aims were fulfilled, the report is clear and relates to individual project aims. Three papers in good journals were published (TAG, Plant Genome). The funds were used in planned structure and amounts.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Jul 22, 2020
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 16, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Apr 12, 2021
Finance
Total approved costs
5,026 thou. CZK
Public financial support
4,267 thou. CZK
Other public sources
759 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK