Large scale fish and water environment screening to assess the biodiversity of the Myxozoa: A metagenomic approach
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 20 (SGA0201600001)
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-20744S
Alternative language
Project name in Czech
Využití metagenomického přístupu k odhalování biodiverzity rybomorek na základě rozsáhlého skríningu ryb a vzorků z vodního prostředí
Annotation in Czech
Druhová diverzita rybomorek (Myxozoa) je stále velmi nejasná, přičemž poznání biodiverzity je velmi důležitou součástí výzkumu parazitických organismů. Navrhujeme průkopnickou identifikaci rybomorek pomocí širokospektrého skrínování vzorků vodního prostředí, abychom získali nový pohled na jejich diverzitu, ekologii a evoluci. Skloubíme tradiční popisné metody s inovativními metagenomickými přístupy, které umožní překonat překážky dosud omezující poznání diverzity rybomorek. Vyšetřování rybích hostitelů z různých oblastí světa, skrínování vzorků vody za účelem detekce volně žijících stádií a analýza meiofauny jako souboru potencionálních definitivních hostitelů nám umožní vyplnit prázdná místa v poznání ekologie rybomorek. Budou nás zajímat i jejich příbuzenské vztahy odvozené na základě získaných dat. Rybomorky jsou problémovými patogeny v rybích akvakulturách, ale zároveň úžasnou skupinou organismů, na které lze studovat evoluci parazitismu. Výsledky projektu umožní vyplnit mezery ve stále neodhalené biodiverzitě a evoluci těchto významných rybích parazitů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EH - Ecology - communities
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The aims of the project have been succeded. Altogether 4 papers have published in international scientific journals and one PhD student have been involved within the project.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Dec 31, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 16, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jun 12, 2019
Finance
Total approved costs
8,262 thou. CZK
Public financial support
7,707 thou. CZK
Other public sources
540 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK