Chromera velia as a model organism to study evolution of apicomplexans and chrompodellids
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 20 (SGA0201600001)
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-24027S
Alternative language
Project name in Czech
Chromera velia jako modelový organismus pro studium evoluce výtrusovců a chrompodelidů
Annotation in Czech
Chromera velia je chromeridní řada se sekundárním plastidem, která se ukázala být nejbližším fototrofním příbuzným prvoků kmene Apicomplexa. Vzhledem k faktu, že byl osekvenován jaderný, plastidový i mitochondriální genom, a také díky jedinečné fylogenetické pozici, C. velia může aspirovat na to stát se modelovým organismem pro studium evoluce parazitismu v celé skupině zahrnující fototrofní, chromeridní řasy, dravé colpodellidy a parazitické výtrusovce. Jednou z podmínek pro modelový organismus je i dostupnost funkčního transfekčního systému. Tento projekt je proto zaměřen na vývoj transfekčního systému u C. velia. Metodická část projektu pak bude doplněna studií proteomu unikátní mitochondrie C. velia. Kombinace bioinformatického přístupu s experimentálními lokalizacemi by měla dát poměrně přesný obrázek o složení proteomu C. velia. Dostupnost mitochondriálního proteomu pak otevírá dveře pro detailní funkční a metabolomické studie tohoto zajímavého prvoka.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EF - Botany
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project has provided valuable information on the life cycle and metabolism of chromerids. In addition, the authors published several papers focusing on the evolution of heme synthesis and plastid endosymbiosis. The results of the project were published in eight, usually high-quality, impacted papers and two book chapters. The funds were spent economically, effectively, and efficiently.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Nov 29, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 16, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jul 2, 2020
Finance
Total approved costs
5,886 thou. CZK
Public financial support
5,457 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
429 thou. CZK