Sequence-based phylogeny of Glomeromycota: from virtual taxa to phylospecies and global ecological and biogeographical patterns
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Main participants
Botanický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
17-03921S
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární fylogeneze Glomeromycota: od virtuálních taxonů k fylogeneticky vymezeným druhům a globální ekologii a biogeografii
Annotation in Czech
Přes značný ekologický a zemědělský význam arbuskulárních mykorhizních (AM) hub je doposud málo známo o jejich celkovém rozšíření a diverzitě. Z cca 250 popsaných druhů jsou sekvence DNA k dispozici jen pro malou část. Počet „taxonů“ vymezených pouze na základě environmentálních sekvencí DNA navíc značně převyšuje počet popsaných druhů, takže druhový koncept AM hub vyžaduje předefinování na základě molekulárních dat. Jedním z prvních pokusů shromáždit sekvenční data AM hub je databáze MaarjAM obsahující i příslušná metadata, která ovšem v současnosti zahrnuje sekvence pokrývající různé úseky rDNA. Předkládaný projekt si klade za cíl inovovat tuto databázi doplněním nových sekvencí téměř kompletní rDNA pro popsané druhy AM hub ze sbírek a vybrané druhově bohaté environmentální vzorky. Na základě toho bude možné definovat bioinformatická kritéria pro analýzy dat na různých úrovních taxonomie, provést robustní fylogenetickou analýzu, porovnat výsledky stávajících studií společenstev AM hub a studovat ekologii, rozšíření a diverzitu těchto hub v globálním měřítku.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EH - Ecology - communities
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2017
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
—
Latest support payment
Apr 26, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-R/13:1
Data delivery date
Feb 22, 2021
Finance
Total approved costs
7,272 thou. CZK
Public financial support
6,804 thou. CZK
Other public sources
468 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK