Chemical modification and electrochemical analysis of nucleic acids as a new tool in molecular oncology
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.<br>Masarykův onkologický ústav
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
17-08971S
Alternative language
Project name in Czech
Chemická modifikace a elektrochemická analýza nukleových kyselin jako nový nástroj v molekulární onkologii
Annotation in Czech
Analýza DNA a RNA je v molekulární onkologii velice důležitá zejména pro včasnou diagnostiku nádorových onemocnění. Proto jsou vyvíjeny levnější a rychlejší experimentální techniky, mezi které patří i elektrochemie. Elektrochemické metody umožňují snadnou miniaturizaci systému a paralelní detekci vzorků. Chceme využít vlastností elektrochemické analýzy k navržení metod detekce DNA nebo RNA sekvencí i analýzy DNA metylace jakožto epigenetické modifikace regulující genovou expresi. Konkrétně půjde o stanovení přítomnosti onkogenní virové DNA, např. DNA z lidských papilomavirů (HPV) způsobujících rakovinu děložního hrdla, a detekci krátkých mikroRNA sekvencí, rovněž důležitých při regulaci genové exprese, mj. různých onkoproteinů a tumor supresorových proteinů. Chceme dále vyvinout metodu pro rozlišení metylované a nemetylované DNA, protože změny v metylaci důležitých genových promotorů mohou vést ke vzniku rakoviny, včetně rakoviny děložního hrdla způsobené právě přítomností HPV.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CG - Electrochemistry
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project led to the development of new methods for detection of specific DNA and microRNA sequences by means of electrochemistry. These methods can be effectively used in molecular oncology for early cancer diagnostics. Moreover, the project resulted in 18 impacted publications (and 3 papers in SCOPUS database – in the Czech medical journals).
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2017
Realization period - end
Dec 31, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 22, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
Jul 23, 2020
Finance
Total approved costs
6,782 thou. CZK
Public financial support
6,356 thou. CZK
Other public sources
419 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK