Are the associated bacteria and waste metabolite responsible for the decline of populations house dust mites?
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Main participants
Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
17-12068S
Alternative language
Project name in Czech
Regulují asociované bakterie v interakci s metabolity populace prachových roztočů?
Annotation in Czech
Předpokládáme, že za kolaps populací prachových roztočů jsou zodpovědné s nimi asociované bakterie v kombinaci s odpadním metabolitem dusíku guaninem. V různých fázích vývoje populací roztočů v čase budeme studovat bakteriom, produkci antibakteriálních a dalších interagujících proteinů, zásobní látky a zdravotní stav roztočů. Zaměříme se na studium různých populací laboratorních kultur dvou druhů prachových roztočů Dermatophagoides pteronyssinus a D. farinae ve fázích růstu a kolapsu. Dále navodíme uměle fázi kolapsu přidáním bakteriálního izolátu anebo metabolitu guaninu. Metodický přístup zahrnuje bezgelovou a gelovou proteomickou analýzu změn v roztočích využívající námi konturované databáze z genomu a transkriptomu, identifikaci bakterií pomocí nových metod sekvenování, mikroanatomickou lokalizaci bakterií, sledování populačního růstu roztočů, stanovení lipidů, glykogenu, sacharidů a proteinů a metabolitu guaninu. Projekt přinese nové poznatky o interakci mezi bakteriemi, metabolitem a roztoči, a také nové identifikované bakterie a popsané proteiny. Výstupy bude 5 publikací.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EG - Zoology
CEP - secondary branch
EH - Ecology - communities
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project solves the problem of house dust mites, D. pteronyssinus and D. farinae and the role of their microbiome (bacteria, fungi, yeast) on their population characteristics (abundance, population growth etc.) and production of allergens, which are many and are e.g. sex dependent. Highly valuable findings are summarized in six papers and two manuscripts.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2017
Realization period - end
Dec 31, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 4, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
Jul 23, 2020
Finance
Total approved costs
4,103 thou. CZK
Public financial support
3,125 thou. CZK
Other public sources
978 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK