Spatial and temporal characterization of DNA replication in phylogeneticaly related plant species with contrasting genome sizes
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Main participants
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
17-14048S
Alternative language
Project name in Czech
Časová a prostorová charakterizace replikace příbuzných rostlinných druhů s kontrastní velikostí genomů
Annotation in Czech
DNA replikace je nezbytná pro růst a vývoj všech eukaryotních organismů. Genetická informace je replikována v S fázi buněčného cyklu tak, aby k replikaci došlo pouze jednou v průběhu buněčného cyklu. I když jsou některé základní mechanismy replikace genomu eukaryot konzervované, byly u rostlin v porovnání s živočichy zjištěny některé odlišnosti. Dosud však byla replice DNA studována pouze u omezeného počtu rostlinných druhů. Cílem projektu je získat nové poznatky o replikaci dvou příbuzných rostlinných druhů lišících se velikostí genomu, včetně organizace tohoto důležitého procesu v trojrozměrném prostoru buněčného jádra a objasnit vztah mezi transkripční aktivitou sekvencí DNA a dobou jejich replikace v průběhu S fáze. Průběh replikace kolineárních genových oblastí bude analyzován u ječmene, který se vyznačuje velkým genomem (asi 80% představují repetitivní sekvence DNA) a malým genomem Brachypodia. Pro řešení projektu budou využity multidisciplinární přístupy zahrnující průtokovou cytometrii, molekulární cytogenetiku, 3D mikroskopii, sekvenování nové generace a bioinformatiku.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2017
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
—
Latest support payment
Apr 10, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-R/13:1
Data delivery date
Feb 22, 2021
Finance
Total approved costs
5,198 thou. CZK
Public financial support
4,463 thou. CZK
Other public sources
735 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK