MolMeDB - Validated Predictions of Small Molecule Interactions with Biological Membranes
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Main participants
Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
17-21122S
Alternative language
Project name in Czech
MolMeDB - Ověřené predikce interakcí nízkomolekulárních látek s biologickými membránami
Annotation in Czech
Bariéra, rezervoár, nebo molekulární cíl – to jsou jen některé funkce, které hrají biologické membrány v komplexní výměně látek v organismu. Detailní znalost interakcí mezi molekulami a membránami je tak podmínkou pro lepší pochopení funkce molekul v organismu. Většina dnešních nízkomolekulárních léčiv má amfifilní charakter, což jim umožňuje interagovat s biologickými membránami. Totéž platí i pro řadu endobiotik. A přesto je nejčastějším a často jediným parametrem používaným k popisu interakce molekul s membránou ve většině databází partiční koeficient oktanol/voda (logP). Protože biologické membrány nejsou tvořeny oktanolovou fází, navrhujeme shromáždit a vypočítat detailní informace o afinitě, pozicování a penetraci látek membránami v otevřeně přístupné databázi MolMeDB s cílem vytvořit validovanou teoretickou predikci směřování, funkční pozice a průniku molekul u jednotlivých typů biologických membrán.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
CEP - another secondary branch
FR - Pharmacology and apothecary chemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10403 - Physical chemistry<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30104 - Pharmacology and pharmacy
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2017
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
—
Latest support payment
Jun 14, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-R/11:1
Data delivery date
Feb 22, 2021
Finance
Total approved costs
4,971 thou. CZK
Public financial support
4,554 thou. CZK
Other public sources
417 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK