Molecular mechanisms of proliferation during tumor progression and wound healing studied by profiling on single cell level
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Main participants
Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
17-24441S
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární mechanismy během vývoje nádoru a hojení poranění studované profilováním na úrovni jednotlivých buněk
Annotation in Czech
Biologické vzorky, jako tkáně, biopsie a dokonce buněčné kultury jsou vysoce heterogenní. Heterogenita vzorku je hlavním zdrojem problematické variability v moderní diagnostice a výzkumu. Nedávno zavedená analýza na úrovni jednotlivých buněk nabízí studovat heterogenitu s buněčným rozlišením a vyhnout se tak omezením v interpretaci dat. Náš ústav má dlouhodobou tradici v jednobuněčné analýze s použitím různých biologických modelů a technik. Cílem našeho návrhu je určit podobnosti a rozdíly v signalizačních drahách na jednobuněčné úrovni, které regulují dva biologické procesy, hojení ran a vývoj nádoru. Někdy je růst nádoru považován za abnormálně se hojící ránu. Bohužel chybí komplexní komparativní analýza. Použijeme transkriptomovou analýzu k objevení klíčových kroků a drah během vývoje rakoviny a hojení ran v embryonální a dospělé pokožce. Naše první výsledky naznačují účast drah jako Wnt a Ap1. Zavedení účinného protokolu povede ke zlepšení diagnostických přístupů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project was not solved very efficiently and successfully. Only one publication (IF 3.7) focused on specific goal 1 was created. Other goals were not successfully solved, but several (methodological) publications were generated (with project dedications) that are not related to the project goals. Several PhD students were involved and their work was presented on posters.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2017
Realization period - end
Dec 11, 2020
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 14, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Apr 12, 2021
Finance
Total approved costs
7,236 thou. CZK
Public financial support
7,236 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK