High-fidelity fast tracking of protein motion mechanisms
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 22 (SGA0201800001)
Main participants
Ústav fotoniky a elektroniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
18-19705S
Alternative language
Project name in Czech
Vysokorychlostní snímání pohybu a mechanismů motorových proteinů
Annotation in Czech
Navzdory stávajícím detailním znalostem struktur velkého množství proteinů, včetně molekulárních motorů, pochopení jejich chemické a mechanické funkce zůstává často v rovině spekulací a modelů. V tomto projektu posouváme limity přesnosti a rychlosti přímého optického trasování pohybu molekul proteinů a využijeme tuto novou metodu k rozklíčování řízeného a difuzního pohybu proteinů podél cytoskeletálních mikrotubulů. Základním experimentálním konceptem je interferometrické detekce rozptylu světla na nanočásticích, která byla nedávno řešitelem rozšířena i na neoznačené proteiny (iSCAT). Naše předběžné experimenty ukazují možnost trasování extrémně malých rozptylových značek s nanometrovou přesností při mikrosekundových expozicích. Tento technologický skok doplňujeme novou strategií značení proteinů pomocí ultra krátké chemické kotvy pro velmi přesné trasování polohy označené části proteinu. Tímto způsobem budeme schopni sledovat jak skokové změny polohy koncových rovnovážných stavů, tak i trajektorie mezilehlých stavů podél energetických gradientů řídících tento pohyb.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10610 - Biophysics
OECD FORD - secondary branch
10306 - Optics (including laser optics and quantum optics)
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
BH - Optics, masers and lasers<br>BO - Biophysics
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2018
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
—
Latest support payment
Apr 24, 2020
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-R/10:1
Data delivery date
Feb 22, 2021
Finance
Total approved costs
7,197 thou. CZK
Public financial support
6,435 thou. CZK
Other public sources
762 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK