Ultrafast spectroscopy as a tool for elucidation the structure-function relationship in cyanobacterial carotenoid-binding proteins
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 22 (SGA0201800001)
Main participants
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
18-21631S
Alternative language
Project name in Czech
Ultrarychlá časová spektroskopie jako nástroj pro studium vztahu mezi strukturou a funkcí karotenoproteinů u sinic
Annotation in Czech
Projekt má za cíl využít možností pokročilých metod ultrarychlé časově rozlišené spektroskopie ke studiu interakcí mezi karotenoidem a proteinem v karotenoproteinech ze sinic. V sinicích byly objeveny specifické karotenoproteiny (OCP), které jsou fotoaktivní a po aktivaci získávají fotoprotektivní funkci, jež je zajištěna prostřednictvím zhášení fluorescence vnějších antén, fykobilisomů, přičemž toto zhášení zajišťuje právě OCP. Mechanismus tohoto zhášení je stále neznámý. K řešení projektu budou využity nové metody ultrarychlé spektroskopie, které umožňují získat hlubší informace o vlastnostech (spektra, doby života, vibrační frekvence) excitovaných stavů karotenoidů. Jelikož tyto vlastnosti jsou velmi citlivé na změnu vnějšího prostředí, v projektu se zaměříme na vliv proteinu na S1 a ICT (stav přenosu náboje) stavy u karbonylových karotenoidů, které jsou typicky přítomny v OCP. Srovnávací experimenty (rozpouštědlo vs. protein) poskytnou přímou informaci o typu interakce karotenoidu s proteinem, umožní srovnat různé typy OCP a prozkoumat mechanismus zhášení.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10610 - Biophysics
OECD FORD - secondary branch
10301 - Atomic, molecular and chemical physics (physics of atoms and molecules including collision, interaction with radiation, magnetic resonances, Mössbauer effect)
OECD FORD - another secondary branch
10403 - Physical chemistry
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
BE - Theoretical physics<br>BO - Biophysics<br>CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2018
Realization period - end
Dec 31, 2020
Project status
—
Latest support payment
Apr 24, 2020
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-R/10:1
Data delivery date
Feb 22, 2021
Finance
Total approved costs
4,594 thou. CZK
Public financial support
4,166 thou. CZK
Other public sources
428 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK