Constrained analysis of reaction networks - a tool for experimental validation of models of biochemical and photobiological reactors
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 22 (SGA0201800001)
Main participants
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta chemicko-inženýrská
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
18-24397S
Alternative language
Project name in Czech
Analýza reakčních sítí s omezujícími podmínkami - nástroj pro experimentální validaci modelů biochemických a fotobiologických reaktorů
Annotation in Czech
Navrhovaný výzkum je zaměřen na dynamiku biochemických reakcí in vitro a in vivo zkoumaných z pohledu oscilací a jiných emergentních jevů, které vznikají prostřednictvím interakce podsystémů. Prvním typem zkoumaných systémů jsou oscilační biochemické reakce v míchaném reaktoru s cílem použít experimentálně zjištěné oscilace k identifikaci kinetických parametrů reakční sítě sloužící jako model systému. Navazujícím systémem jsou propojené biochemické reaktory, v nichž je emergentní jev (Turingova struktura) využit ke konstrukci logických funkcí na biochemickém základě. Hierarchicky nejsložitějším systémem jsou pak fotosyntetizující sinice ve fotobioreaktoru. Experimenálně pozorované metabolické/ultradiánní/cirkadiánní rytmy budou popsány modelem biochemické reakční sítě a původ oscilací bude zkoumán prostředky teorie stability reakčních sítí a bifurkační analýzou. Hlavními cíli jsou sestavení modelu ve formě reakční sítě, formulace metodiky a její aplikace na identifikaci kinetických parametrů při nichž model reprodukuje oscilace/rytmy v uvedených systémech.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
20401 - Chemical engineering (plants, products)
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CI - Industrial chemistry and chemical engineering
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2018
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
—
Latest support payment
Apr 24, 2020
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-R/10:1
Data delivery date
Feb 22, 2021
Finance
Total approved costs
8,101 thou. CZK
Public financial support
7,240 thou. CZK
Other public sources
771 thou. CZK
Non public and foreign sources
90 thou. CZK