Interactions of flaviviral genomic and subgenomic RNA with host and viral proteins
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 22 (SGA0201800001)
Main participants
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
18-27204S
Alternative language
Project name in Czech
Interakce genomové a subgenomové RNA flavivirů s hostitelskými a virovými proteiny
Annotation in Czech
Navrhovaný projekt si klade za cíl charakterizovat interakce na úrovni virus-hostitel v případě medicínsky významných flavivirů – virus dengue (DENV), virus klíšťové encefalitidy (TBEV) a virus zika (ZIKV). Plánujeme se zaměřit na tři témata: (i) charakterizace interakcí virové genomové RNA s kapsidovým C proteinem zodpovědných za formování nukleokapsidy, a to včetně stanovení struktury C proteinu TBEV; (ii) funkční charakterizace a identifikace vazebných partnerů subgenomové flavivirové RNA (sfRNA) derivované z genomu DENV, TBEV a ZIKV; (iii) analýza totalniho transkriptomu (malé a velké RNA) hostitelské odpovědi na infekci TBEV s důrazem na porovnání změn exprese v případě různých typů lidských nervových buněk infikovaných odlišně virulentními kmeny TBEV.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10607 - Virology
OECD FORD - secondary branch
30303 - Infectious Diseases
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EE - Microbiology, virology<br>FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project brought novel information of international importace from the field of flaviviral genome interaction with host and viral proteins. Several high quality papers are the outcome of the project. International collaboration was applied and pregradual as well as postgradual students were significantly involved during the project investigation.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2018
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2021
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GA-U
Data delivery date
Jun 29, 2022
Finance
Total approved costs
12,536 thou. CZK
Public financial support
11,669 thou. CZK
Other public sources
765 thou. CZK
Non public and foreign sources
102 thou. CZK