Biochemical studies of membrane rafts and immunoreceptors based on cell membrane-disintegrating copolymers
Project goals
Biochemical studies on cell membrane microdomains (especially membrane rafts) and membrane receptor complexes have been based on membrane disintegration by detergents, yielding detergent resistant membrane fragments (DRMs). However, the use of detergents is accompanied by artefacts. An alternative has emerged in the form of amphiphilic copolymers, especially styrene-maleic acid (SMA) copolymers, which cut the membrane into nanodiscs containing membrane proteins in their native-like membrane environment. In this project, we will extend and optimize this approach for studies on selected receptor complexes and membrane microdomains of various cell types, mainly leukocytes. We will prepare a library of amphiphilic copolymers, comprising variants described in literature as well as newly developed ones. We will optimize the copolymer properties so as to afford nanodiscs preserving native membrane rafts and immunologically important receptor complexes. This will enable identification and detailed characterization of factors and molecular components essential for these membrane entities.
Keywords
copolymerSMAmembrane raftsmicrodomainsmembrane receptorsleukocytes
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 23 (SGA0201900001)
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-04047S
Alternative language
Project name in Czech
Biochemické studie membránových raftů a imunoreceptorů založené na kopolymerech desintegrujících buněčné membrány
Annotation in Czech
Biochemické studie mikrodomén buněčných membrán (zejména tzv. membránových raftů) a membránových receptorových komplexů byly dosud založeny na dezintegraci membrán detergenty vedoucí k „detergent-rezistentním membránovým fragmentům“ (DRMs). Použití detergentů ale vede k některým artefaktům. Nedávno objevenou alternativou je použití amfifilních kopolymerů, především kopolymerů styrenu a kys. maleinové (SMA), které z membrán „vysekávají“ nanodisky, v nichž jsou membránové proteiny přítomné v relativně přirozeném lipidovém prostředí. V tomto projektu chceme tento přístup rozšířit a optimalizovat pro studium složení a vlastností receptorových komplexů a membránových mikrodomén různých typů buněk s důrazem na leukocyty. Připravíme knihovnu amfifilních kopolymerů zahrnující jak typy popsané v literatuře tak nově vyvinuté. Vlastnosti kopolymerů optimalizujeme pro přípravu nanodisků zachovávajících raftové mikrodomény a imunologicky důležité receptorové komplexy. To umožní identifikovat a biochemicky charakterizovat faktory a molekulární komponenty důležité pro tyto membránové entity.
Scientific branches
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2023
Project status
—
Latest support payment
May 12, 2021
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 22, 2022
Finance
Total approved costs
7,933 thou. CZK
Public financial support
7,648 thou. CZK
Other public sources
285 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
7 933 CZK thou.
Public support
7 648 CZK thou.
96%
Provider
Czech Science Foundation
OECD FORD
Polymer science
Solution period
01. 01. 2019 - 31. 12. 2023