Molecular portraits of major morphological components of colon tumors
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 23 (SGA0201900001)
Main participants
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-08646S
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární portréty hlavních morfologických komponent nádorů kolorekta
Annotation in Czech
Vnitřní nádorová heterogenita je hlavním problémem, který brání správnému výběru účinné léčby. V tomto projektu budeme zkoumat vnitřní nádorovou heterogenitu analýzou prostorové variability celogenomových expresních profilů v primárních nádorech tlustého střeva II. a III. stadia. Profily genové exprese budou extrahovány z dobře morfologicky definovaných a odlišných oblastí a budou použity pro konstrukci jejich charakteristických molekulárních profilů a pro studium již existujících prognostických a prediktivních molekulárních signatur včetně konsenzuálních molekulárních podtypů. Tento přístup přinese nové poznatky týkající se nádorové biologie tohoto karcinomu a propojí morfologii nádoru s genovou expresí. Propojením RNA extrakce s morfologicky jasně vymezenými oblastmi nádoru zlepšíme přesnost používaných molekulárních signatur a jejich reproducibilitu. Tyto data poslouží k vývoji metod pro dekompozici signálu exprese na individuální komponenty specifické pro jednotlivé oblasti, které pak mohou být aplikovány na existující smíšené molekulární profily k detekci nových biomarkerů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
30204 - Oncology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
FD - Oncology and haematology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Jun 30, 2022
Project status
—
Latest support payment
Apr 1, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-GA0-GA-R
Data delivery date
Jun 26, 2023
Finance
Total approved costs
7,244 thou. CZK
Public financial support
6,853 thou. CZK
Other public sources
390 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK