Parasites as tags for pelagic freshwater clupeid fish populations in Lake Tanganyika (Africa): comparing parasite and host genomics
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 23 (SGA0201900001)
Main participants
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-13573S
Alternative language
Project name in Czech
Parazité jako ukazatelé populační struktury sleďovitých ryb jezera Tanganika (Afrika): srovnání genomických dat parazita a hostitele
Annotation in Czech
Ač je pelagická oblast největším habitatem Země, zůstávají mnohé z jejich základních principů hostitelsko-parazitárních systémů neznámé. Je tomu tak i v případě jezera Tanganika, jenž je největším a nejstarším tropickým sladkovodním jezerem světa. V porovnání s jeho bohatou litorální rybí faunou, dominují pelagické zóně dva druhy endemických sleďů (Clupeidae) a jejich predátoři (Latidae). Předkládaný projekt se zabývá studiem populační struktury sleďů, Limnothrissa miodon a Stolothrissa tanganicae, ve všech třech částech jezera. Metazoární parazitofauna bude porovnána mezi populacemi obou hostitelských druhů. Celogenomové sekvenování restrikčních fragmentů a analýza mitochondriálního genomu parazitů budou dále využity ke studiu fylogeografie. Porovnání získaných dat s genetickou populační strukturou hostitelů umožní testování parazitů jako ukazatelů obsádkové struktury rybích populací jezera Tanganika. Tento projekt ukazuje význam jezera nejen jako důležitého modelového systému pro evoluční biology ale také pro ichthyoparazitologii a management rybolovu tropických oblastí.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EA - Morphology and cytology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Basic data on the diversity and genetics of parasites of two clupeid species occurring in three subbasins of Lake Tanganyika were obtained. Several postgraduate students were also involved in the project, which is characterized by broad international collaboration. The output of the project is 9 publications in international journals.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Jun 30, 2022
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-GA0-GA-U
Data delivery date
Jun 26, 2023
Finance
Total approved costs
7,732 thou. CZK
Public financial support
7,633 thou. CZK
Other public sources
96 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK