Driver mutations in cancer genome of Nothobranchius furzeri: from tumor biology to concept of experimental model of spontaneous carcinogenesis
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 23 (SGA0201900001)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-20873S
Alternative language
Project name in Czech
Klíčové mutace v nádorovém genomu Nothobranchius furzeri: od nádorové biologie k návrhu experimentálního modelu sporadické kancerogeneze
Annotation in Czech
Africká anuální ryba Nothobranchius furzeri se v posledních letech stala atraktivním modelovým druhem především v oblasti výzkumu různých aspektů stárnutí. Výjimečnost N. furzeri je dána především extrémně krátkým životním cyklem, rekapitulujícím standardní průběh stárnutí obratlovců v kondenzované podobě a spontánní, věkem podmíněnou karcinogenezí. V pilotním experimentu jsme na rybách inbrední linie N. furzeri popsali incidenci neoplasií v játrech a ledvinách. Výstupem experimentu využívajícího přístup celoexomového sekvenování byla také detekce řady mutací v genech funkčně se podílejících na maligní transformaci. Cílem předkládaného projektu je identifikovat driverové mutace v onkogenech a tumor-supresorových genech a následně charakterizovat jejich roli v procesu maligní transformace u jaterní a ledvinové tkáně N. furzeri. Pro detekci a charakterizaci driverových mutací bude použita metoda celogenomového sekvenování a příslušné bioinformatické nástroje. Vybrané mutace budou studovány in vivo CRISPR/Cas9 mutagenezí. N. furzeri bude popsán jako model sporadické kancerogeneze.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2023
Project status
—
Latest support payment
Apr 30, 2021
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 22, 2022
Finance
Total approved costs
8,311 thou. CZK
Public financial support
7,774 thou. CZK
Other public sources
537 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK