The utility of atmospheric pressure gas-phase ionizations in mass spectrometry of peptides
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202000001
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
20-09126S
Alternative language
Project name in Czech
Využití ionizací v plynné fázi za atmosferického tlaku pro hmotnostní spektrometrii peptidů
Annotation in Czech
Hmotnostní spektrometrie (MS) s elektrosprejovou ionizací (ESI) je jednou z nejvýznamnějších metod v proteomice. Ve spojení s chromatografií umožňuje identifikovat a kvantifikovat tisíce proteinů v biologických vzorcích. Tento přístup má však svá omezení. Významná část peptidů není detekována zejména kvůli supresním efektům v ESI, což snižuje hodnoty pokrytí sekvencí i počty detekovaných proteinů. V tomto projektu navrhujeme použít ionizační metody v plynné fázi pro získání komplementárních proteomických dat. Chemická ionizace (APCI) a fotoionizace (APPI) za atmosférického tlaku jsou běžné ionizační techniky v MS. Jejich využití pro peptidy je obecně vnímáno jako nemožné, přestože některé peptidy mohou být detekovány ještě citlivěji než v ESI. V tomto projektu chceme zkoumat využitelnost APCI-MS a APPI-MS pro analýzu peptidů. Navrhujeme využít chemickou derivatizaci pro zvýšení hydrofobicity a tím i detekovatelnosti peptidů v APCI a APPI. Vyvineme iontový zdroj pro APCI a APPI, který bude kompatibilní s nízkými průtoky vzorků používanými v proteomice.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10406 - Analytical chemistry
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CB - Analytical chemistry, separation
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2020
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
—
Latest support payment
Apr 8, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-GA0-GA-R
Data delivery date
Jun 26, 2023
Finance
Total approved costs
5,179 thou. CZK
Public financial support
4,039 thou. CZK
Other public sources
1,101 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK