Mapping of the rat circadian metabolome in brain and peripheral tissues during embryonic to postnatal development
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202000001
Main participants
Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
20-21114S
Alternative language
Project name in Czech
Mapování cirkadiánního metabolomu mozku a periferních tkáních potkana během embryonálního a postnatálního vývoje
Annotation in Czech
Cirkadiánní rytmus během embryonálního a postnatálního vývoje je již řadu let rozsáhle studován pomocí transkriptomiky. Bylo tak prokázáno postupné zrání cirkadiánní variace hodinových genů. Doposud se však žádné studie nezaměřily na studium cirkadiánní rytmicity během vývoje na komplexní úrovni metabolitů. Bude testována hypotéza, že cirkadiánní metabolom je do značné míry ovlivněn vývojovým stadiem a pomocí globálního metabolomického a lipidomického profilováním bude možné nahlédnout do dynamických vztahů metabolitů a zachytit metabolické změny tkání potkana. Provedeme 24hodinový metabolomický a lipidomický profil tří tkání a plazmy potkana v různých vývojových stadiích (embryonální E19, postnatální P2, P10, P20, P28). Pro stadia P20 a P28 bude tento přístup rozšířen o další typy tkání pro vytvoření komplexního atlasu cirkadiánního metabolismu. Dále bude vyvinut nový pracovní postup pro snížení falešných struktur během identifikace „neznámých“ metabolitů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10605 - Developmental biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2020
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
—
Latest support payment
Apr 8, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-GA0-GA-R
Data delivery date
Jun 26, 2023
Finance
Total approved costs
6,902 thou. CZK
Public financial support
6,902 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK