Fungal stable isotope fractionation (FUNSIF): a proxy of microbial metabolism in soils
Project goals
Microbial activity in soils controls both the size and mineralization of large carbon (C) inventories stored in the subsurface, having important consequences for the partitioning of C between terrestrial and atmospheric reservoirs as well as the recycling of nutrients that support plant growth. Fungi are major decomposers of soil organic matter (SOM); however, uncertainty in the predominant C substrates that fuel respiration confound models of fungal production and SOM turnover. To further constrain microbial regulation of the C balance in soils, the proposed research will employ an innovative dual stable isotope probing approach to determine the isotopic fractionation of water isotopes and incorporation of inorganic 13C during fungal lipid biosynthesis for species available in the Collection of Microscopic Fungi and in experimental incubations of forest soil. This information will deliver quantitative production estimates across a wide diversity of fungal ecotypes and help to delineate the relative importance of fungal, bacterial, and archaeal catabolic pathways in soil.
Keywords
biogeochemistrysoilmicrobiologydecomposerscarbon-cycleturnovermetabolismbiomarkerisotopesdeuterium
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202000001
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
20-22380S
Alternative language
Project name in Czech
Frakcionace stabilních izotopů houbami: měření mikrobiálního metabolismu v půdách
Annotation in Czech
Mikrobiální aktivita půdy řídí velikost zásoby i mineralizaci organických látek v půdě. Má proto významný vliv na rozdělování C mezi terestrickými a atmosférickými reservoáry a na recyklaci živin potřebných pro růst rostlin. Přestože jsou houby hlavními dekompozitory půdní organické hmoty (SOM), stále panuje nejistota, jaké substráty jsou využívány v respiračních pochodech. To vnáší nejistotu do modelů zaměřených na odhad produkce hub a obratu SOM. Abychom vysvětlili mikrobiální regulaci bilance C v půdě, využijeme inovativní přístup duálního značení hub stabilními izotopy k determinaci izotopové frakcionace izotopů vody a inkorporace anorganického 13C při metabolismu lipidů. V experimentech použijeme kmeny se Sbírky mikroskopických hub a experimentální inkubace v lesní půdě. Tímto způsobem uděláme kvantitativní odhad produkce velkého souboru houbových ekotypů a vymezíme relativní význam katabolických cest hub, bakterií a archeí.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10511 - Environmental sciences (social aspects to be 5.7)
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
DI - Pollution and air control
DJ - Pollution and water control
DK - Contamination and decontamination of soil including pesticides
DL - Nuclear waste, radioactive pollution and control
DM - Solid waste and its control, recycling
DO - Protection of landscape
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2020
Realization period - end
Jun 30, 2023
Project status
—
Latest support payment
Apr 1, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-R
Data delivery date
May 21, 2024
Finance
Total approved costs
10,069 thou. CZK
Public financial support
10,069 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Recognised costs
10 069 CZK thou.
Public support
10 069 CZK thou.
0%
Provider
Czech Science Foundation
OECD FORD
Environmental sciences (social aspects to be 5.7)
Solution period
01. 01. 2020 - 30. 06. 2023