Cyclic peptides and depsipeptides - markers of fungal infections
Project goals
Fungi and bacteria produce cyclic peptides and depsipeptides by multifunctional peptide synthetases. Due to the complexity and magnitude of these multienzymatic systems we assume, that a single strain would be able to produce a particular class of thesemetabolites only, which thus might serve as taxonomic marker. The key aim of this grant proposal is to study the production and diversity of cyclic peptides of the fungi of the genus Aspergillus, particularly of the strains pathogenic to humans. Fungi will be cultivated, extracts purified by preparative HPLC methods, and cyclic peptides will be identified by a set of combined LC/MSn and NMR methods. The final target of the grant is to test our hypothesis that the detection of these secondary metabolitesin biological fluids of infected humans could facilitate an early diagnosis of responsible fungal pathogen and effective treatment of fungal infection.
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Cyklické peptidy a depsipeptidy jako fungální markery
Annotation in Czech
Houby a bakterie produkují cyklické peptidy a depsipeptidy pomocí multifunkčních enzymatických systémů. Vzhledem k jejich velikosti a složitosti lze předpokládat, že jednotlivý kmen by měl produkovat vybraný typ těchto metabolitů použitelný jako taxonomický marker. Hlavním cílem grantového návrhu je studium cyklických peptidů z hub rodu Aspergillus, zejména kmenů patogenních pro člověka. Houby budou kultivovány, extrakt bude přečištěn preparativní HPLC a cyklické peptidy budou identifikovány pomocí různých kombinovaných LC/MSn a NMR metod. Konečným záměrem grantu je prověřit hypotézu, podle níž by detekce těchto sekundárních metabolitů v tělních tekutinách pacientů mohla být velmi užitečná pro včasnou identifikaci houbového patogenu a účinnoléčbu infekce.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
FJ - Surgery including transplantology
CEP - secondary branch
CB - Analytical chemistry, separation
CEP - another secondary branch
CE - Biochemistry
10406 - Analytical chemistry
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30212 - Surgery
30213 - Transplantation
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Projekt zaměřený na studium cyklických peptidů s perspektivou jejich využití jako markery pro diagnostiku patogenních hub vycházel z testování přibližně sta producentů. Byly vyvinuty techniky pro identifikaci cyklických peptidů (FAB, ESI, MALDI-MS, 2D NM
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2000
Realization period - end
Jan 1, 2002
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2003/GA0/GA03GA/U/N/9:7
Data delivery date
May 19, 2008
Finance
Total approved costs
2,232 thou. CZK
Public financial support
1,975 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
2 232 CZK thou.
Public support
1 975 CZK thou.
88%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
FJ - Surgery including transplantology
Solution period
01. 01. 2000 - 01. 01. 2002