Identification of genes involved in nitrate transport in P. denitrificans and basic biochemical characterisation on their products
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Main participants
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Identifikace genů pro transport dusičnanů u P. denitrificans a základní biochemická charakterizace jejich produktů
Annotation in Czech
Projekt navazuje na dlouhodobou tradici studia denitrifikačních procesů u bakterií na daném pracovišti, kde je studována regulace a kinetika denitrifikace na organizmu Paracoccus denitrificans. Tento projekt by se měl zabývat studiem jednoho z limitníchfaktorů denitrifikace, totiž dostupnosti dusičnanů enzymům denitritikační kaskády. Transportní systém bude studován s pomocí molekulárně biologických přístupů. Jednak budou na základě sekvenčních podobností transportních systémů dusičnanů z jiných zdrojůvytvořeny degenerované primery, kterých bude použito k izolaci genii zodpovědných za transport dusičnanu u P. denitrifîcans. Dále budou hledány faktory regulace bakteriální denitrifikace porovnáním profilu exprimovaných proteinů buněk při růstu na NO3- aNH4+, a za aerobních a anaerobních podmínek na úrovni mRNA. Alternativní cestou by bylo použití transpozonové mutageneze s pomocí transpozonu TnS. V takovém případě budou hledány mutanty P. denitrifîcans neschopné využívat nízkých koncentrací dusičnanů.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Nezhodnoceno.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2000
Realization period - end
Jan 1, 2002
Project status
S - Stopped (prematurely terminated) multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2002/GA0/GA02GA/U/N/7:3
Data delivery date
Apr 1, 2003
Finance
Total approved costs
481 thou. CZK
Public financial support
458 thou. CZK
Other public sources
43 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK