Gene expression and posttranslational modification during germination of aerial spores of streptomycetes
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Genová exprese a posttranslační modifikace v průběhu germinace vzdušných spor streptomycet
Annotation in Czech
Navrhovaný projekt má přispět k objasnění genové exprese v průběhu germinace vzdušných spor streptomycet. Synchronní germinace spor umožní sledovat expresi a posttranslační modifikace proteinů před a po prvé replikaci DNA. Kvantitativní změny v genové expresi modelových proteinů v průběhu germinace budou sledovány pomocí inkorporace 15N do bílkovin. Tryptické peptidy modelových proteinů z 2-D gelů budou identifikovány MALDI-TOF hmotnostní spektrometrií. Relativní obsah proteinů lze odvodit z posunu hmotností. Pulzní značení proteinů a vyhodnocování 2-D gelů fosfor-imagerem umožní sledovat množství radioaktivity inkorporované do všech proteinů v daném čase i posttranslační modifikace. Statistickou analýzou lze určit změny v expresi a detekovat proteiny,které vykazují signifikantní změny. Nízkomolekulární RNA (riboregulátory, sRNA) modulují translaci mnoha mRNA. Budou charakterizovány sRNA u streptomycet a jejich exprese. Hybridizace značené sRNA s restrikčními fragmenty chromosomální DNA
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
CE - Biochemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Our data provide the first evidence on activation and expression of proteins during synchronous germination of aerial spores.The first phase of protein activation is associated with the solubility of proteins. The data shows that aerial spores contain th
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2002
Realization period - end
Jan 1, 2004
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2005/GA0/GA05GA/U/N/B:7
Data delivery date
Jun 2, 2008
Finance
Total approved costs
3,109 thou. CZK
Public financial support
1,573 thou. CZK
Other public sources
1,536 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK