Optical activity and conformation of disulphide bridges in peptides and proteins
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 10 (SGA02007GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
203/07/1335
Alternative language
Project name in Czech
Optická aktivita a konformace disulfidových můstků v peptidech a proteinech
Annotation in Czech
Na základě využití několika modelových látek nalezneme a otestujeme vztah mezi trojrozměrnou strukturou a vibrační optickou aktivitou (hlavně Ramanovou optickou aktivitou - ROA) disulfidové skupiny, kterou je obtížné studovat pomocí klasického cirkulárního dichroismu vzhledem k problémům s degenerací a překryvem pásů. Prostudujeme analytický potenciál ROA pásů S-S a C-S vibrací, které jsme již dříve nalezli v u molekuly hinge peptidu. Vibrační optickou aktivitu disulfidické skupiny budeme studovat pomocí ab initio výpočtů (malé disulfidické modely jako H2S2 a CH3-S-S-CH3) a pomocí srovnání experimerntu a teorie (rigidní a flexibilní malé heterodetní cyklické peptidy). Porovnáme optickou aktivitu disulfidů v rigidním a flexibilním prostředí a zahrneme vliv rozpouštědla. Data vibrační optické aktivity vztáhneme v výsledkům získaným pomocí molekulárního modelování a NMR. Výsledky aplikujeme na konformační analýzu disulfidické skupiny ve větším peptidu/malém proteinu (pravděpodobně
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
CEP - secondary branch
BO - Biophysics
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10403 - Physical chemistry<br>10610 - Biophysics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2007
Realization period - end
Dec 31, 2009
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 22, 2009
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP10-GA0-GA-U/02:2
Data delivery date
Jan 22, 2015
Finance
Total approved costs
2,066 thou. CZK
Public financial support
2,066 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK