Nuclear magnetic resonance studies of oligonucleotide dynamics
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
—
Main participants
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Studium dynamiky oligonukleotidů pomocí NMR spektroskopie
Annotation in Czech
Předmětem návrhu je studium intramolekulární dynamiky 13C a 15N-obohacených oligonukleotidů pomocí NMR spektroskopie. Strukturní fluktuace nukleových kyselin je možno studovat prostřednictvím relaxace jader 15N, 13C a 31P. Hlavní problémy při studiu dynamiky plně izotopicky značených molekul jsou způsobeny vlivem interakce uhlík-uhlík na měřené relaxační parametry uhlíku a skutečností že hodnoty anizotropie chemického posunu (CSA) jader 13C a 15N v nukleových kyselinách nejsou známy. Budeme se zabývat optimalizací pulzních sekvencí pro měření relaxačních rychlostí jader 15N, 13C a 31P a nukleárního Overhauserova jevu (NOE). Pokusíme se eliminovat nebo alespoň omezit vliv interakce uhlík-uhlík na měřené hodnoty relaxačních parametrů uhlíku za pomoci moderních prostředků NMR jako jsou tvarované pulzy, selektivní dekaplink a gradienty magnetického pole. Vyvineme metody pro kvantitativní měření vlivu interference mezi dipolárním relaxačním mechanismem a CSA jako prostředek pro získání relativníc
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10403 - Physical chemistry<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Byla studována dynamika oligonukleotidů pomocí NMR spektroskopie. V nukleových kyselinách bylo k tomuto účelu výhodné využít relaxačních vlastností uhlíku. Kromě studia dynamiky bylo možné relaxačních charakteristik využít i k optimalizaci NMR experiment
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1999
Realization period - end
Jan 1, 2001
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2002/GA0/GA02GA/U/N/7:3
Data delivery date
Apr 1, 2003
Finance
Total approved costs
3,380 thou. CZK
Public financial support
2,380 thou. CZK
Other public sources
3,400 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK