Comparison of class I vs. class II plant formins effects on the dynamics of actin cytoskeleton
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
204/05/0268
Alternative language
Project name in Czech
Porovnání vlivu rostlinných forminů třídy I a II na dynamiku aktinového cytoskeletu
Annotation in Czech
Nevýrazný fenotyp rostlinných mutantů s porušeným Arp2/3 komplexem naznačuje, že rostliny využívají alternativní mechanismus nukleace F-aktinu. Forminy (FH2 proteiny) vykazují aktin-nukleační aktivitu u kvasinek a živočichů, a letos byla publikována první práce naznačující obdobnou funkci u rostlin. Naše bioinformatická analýza odhalila významné rozdíly mezi dvěmi třídami rostlinných forminů. Většina forminů třídy I má na N-konci transmembránovou doménu, avšak chybí jim konzervativní lysinový zbytek, ukvasinkového Bni1p nezbytný pro nukleaci aktinu; rozsáhlá inserce v této oblasti naznačuje alternativní uspořádání aktin-vazebného místa. Většina forminů třídy II odpovídá konsensu FH2; jejich asociaci s membránou by mohla zprostředkovat doménapodobná Pten, jedinečná pro rostliny. Budeme zkoumat vliv vybraných forminů obou tříd na dynamiku aktinového cytoskeletu in vivo, především za použití současné transientní exprese GFP-značených forminů a dsRed-značené aktin-vazebné domény fimbrinu jako
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EA - Morphology and cytology
CEP - another secondary branch
EF - Botany
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Several other groups have recently published studies devoted to plant Class I formins; we thus focused mostly on a representative of the so far uncharacterised Class II formins, in particular on the Arabidopsis AtFH16 protein, whose complete cDNA we have
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 31, 2007
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 2, 2007
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP08-GA0-GA-U/04:3
Data delivery date
Dec 16, 2008
Finance
Total approved costs
1,715 thou. CZK
Public financial support
1,715 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK