Rhodobacter capsulatus genome project
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
—
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
—
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Genomový projekt bakterie Rhodobacter capsulatus
Annotation in Czech
Navrhuje se účast v mezinárodním programu, jehož cílem je stanovit úplnou nukleotidovou sekvenci genomu bakterie Rhodobacter capsulatus. R. capsulatus je bakterie s jedním chromosomem 3.7 Mb a plasmidem 130kb o celkovém obsahu párů GC 70 %. Má fotosyntetický aparát a fixuje vzdušný kyslík. V genomu R. capsulatus byly detegovány změny typu inverzí a transpozicí. Znalost úplné dědičné informace této bakterie může podstatně přispět k objasnění mechanismu těchto pochodů a jejich funkčního významu. Program je přichystán k zahájení, protože byla již konstruována kosmidová encyklopedie genomu a v naší laboratoři byly vypracovány strategie a metody sekvence velkých molekul DNA s extrémním obsahem párů G a C.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Stanovení převážné většiny sekvence nukleotidů fotosyntetizující bakterie Rhodobacter capsulatus a identifikace více než 2000 genů v této sekvenci představuje mimořádný objem kvalitní vědecké práce a rozšiřuje poznatky o genomech bakterií. Charakteristik
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1997
Realization period - end
Jan 1, 1999
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2000/GA0/GA00GA/U/6:2
Data delivery date
—
Finance
Total approved costs
2,247 thou. CZK
Public financial support
1,772 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK