Cyanobacterial cell factory: Modeling and experimental validation of models of photosynthetic energy conversion, of growth, and of production.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 12 (SGA02009GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
206-09-1284
Alternative language
Project name in Czech
Sinice jako buněčná továrna: Modelování a experimentální validace modelů fotosyntetické proměny energie, růstu a produkce cenných látek.
Annotation in Czech
Navrhujeme vytvořit model fotosyntézy sinic a integrovat jej s existujícími modely dalších buněčných procesů, které ovlivňují růst. Zahrneme model cirkadiálního rytmu. Modely budou validovány jak na úrovni jednotlivé buňky tak i na úrovni suspenze v bioreaktoru. Validaci uskutečníme s použitím unikátních přístrojů vyvíjených SME partnerem projektu. V projektu využijeme především jednobuněčnou, diazotropní sinici Cyanothece sp. ATCC 51142, o které předpokládáme, že má významný potenciál v produkci biopaliv a sekvestraci CO2. Prozkoumáme potenciál tohoto organismu vytvářet další cenné látky, které by bylo možné uplatnit např. v léčivech nebo kosmetice. Navrhovaný projekt využije současnou rozsáhlou aktivitu vyvolanou vznikem knihy ?Photosynthesis In Silico? (http://book.ephotosynthesis.org/), kterou navrhovatel tohoto projektu spoluedituje. Významné posílení očekáváme i z interakce se souvisejícími, nikoliv však překrývajícími se zahraničními projekty FIBR-NSF a PLL Grand Challenge (http://www.sysbio.wustl.edu/pakrasi/projects.php). JDE O OPAKOVANÉ PODÁNÍ PROJEKTOVÉHO NÁVRHU - PODROBNÉ VYSVĚTLENÍ VIZ NÍŽE.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
BO - Biophysics
CEP - secondary branch
ED - Physiology
CEP - another secondary branch
EI - Biotechnology and bionics
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10610 - Biophysics<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30105 - Physiology (including cytology)<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
New metabolic cycle of Cyanothece that complements circadian clock depending on metabolome was discovered.Web based platform for modelling of photosynthesis and some innovations like photobioreactor were developed. The work has been published in 12 publications including PNAS. Without budget problems, the aims of the work were fullfilled successfully and results can be considered as excellent.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2009
Realization period - end
Dec 31, 2013
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 12, 2013
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP14-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jul 1, 2014
Finance
Total approved costs
5,533 thou. CZK
Public financial support
5,533 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK